Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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