Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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