Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ECM1Q16610 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
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ECM1Q16610 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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ECM1Q16610 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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ECM1Q16610 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
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ECM1Q16610 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
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