Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NFIXQ14938 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms