Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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