Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
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