Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC124804.1-202ENST00000583712 4315 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 NAA25-201ENST00000261745 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 SMC6-207ENST00000448223 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 CDY1B-202ENST00000382407 2227 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AL445933.1-201ENST00000434240 2242 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 LOXHD1-211ENST00000579038 3632 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 MAPK10-260ENST00000641047 2546 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 KIF23-203ENST00000395392 3357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 THG1L-201ENST00000231198 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 EEF1A1P2-201ENST00000553854 1447 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 HDAC9-229ENST00000622668 4279 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 XIST-211ENST00000635841 1734 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 LINC00703-202ENST00000454152 2390 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 CLEC1A-201ENST00000315330 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 FRMD6-201ENST00000344768 2972 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 ZMYND8-213ENST00000461685 3567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 FMOD-201ENST00000354955 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 COA1-203ENST00000395879 2448 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 ARPP21-203ENST00000396482 2416 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 IL18R1-201ENST00000233957 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 DGKK-201ENST00000611977 7407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 ANO2-202ENST00000356134 3717 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 RETREG1-202ENST00000399793 3145 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 PARP9-201ENST00000360356 3198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 MYO6-204ENST00000369985 8575 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 C14orf2-201ENST00000286953 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 MORN5-201ENST00000373764 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 TRBV10-1-201ENST00000390364 412 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 RPL36A-HNRNPH2-201ENST00000409170 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 FNDC3B-205ENST00000423424 408 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AL021154.1-201ENST00000451217 456 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 DNAJC9-AS1-203ENST00000457758 548 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC123768.1-202ENST00000460684 461 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 RN7SL370P-201ENST00000470869 295 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 IGKV1-16-201ENST00000479981 378 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 RN7SL630P-201ENST00000483714 297 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 MYL5-205ENST00000505477 584 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC079795.1-201ENST00000508847 358 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 ERLIN2-210ENST00000523107 771 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AF001548.1-201ENST00000577048 550 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 TBX18-AS1-208ENST00000591225 762 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 CDC37L1-AS1-201ENST00000607997 463 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC018926.2-201ENST00000611214 498 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC243654.1-201ENST00000620218 293 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 DHX9-201ENST00000367549 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 ABRAXAS1-201ENST00000321945 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC104806.2-201ENST00000502400 1991 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 TMEM167A-201ENST00000502346 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 MAP4-207ENST00000426837 8920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 ZNF322-202ENST00000456172 4718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 ZMYND8-218ENST00000540497 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 L3MBTL4-203ENST00000400105 3546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 FREM1-203ENST00000380894 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 MYH8-201ENST00000403437 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 BUB1B-202ENST00000412359 3628 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 EXOC6-204ENST00000443748 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 SH3BP5-AS1-202ENST00000420195 5570 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 SLMAP-203ENST00000383718 6749 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 SKAP1-201ENST00000336915 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 ZNF833P-202ENST00000635221 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 ARHGEF9-222ENST00000636048 5059 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 MITF-202ENST00000314589 1993 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 PHACTR1-205ENST00000379350 4784 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 GIGYF2-205ENST00000409547 5978 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 LIPH-201ENST00000296252 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 NVL-203ENST00000391875 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 POLR1B-203ENST00000409894 4457 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 STK36-201ENST00000295709 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 LINC01555-201ENST00000370624 2884 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 USP40-203ENST00000427112 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 PTPRE-202ENST00000306042 4957 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 THEM5-201ENST00000368817 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms