Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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