Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 PWAR5-201ENST00000624480 3180 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
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FOXC1Q12948 TNPO3-204ENST00000482320 3585 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 GYG2-209ENST00000639373 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 CAND1-208ENST00000545606 11251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 BUB1B-201ENST00000287598 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
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FOXC1Q12948 PSEN1-205ENST00000406768 4062 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 BFAR-201ENST00000261658 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 RUBCNL-202ENST00000378784 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 DLGAP5-201ENST00000247191 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 PAAF1-202ENST00000376384 1500 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 NUDT13-203ENST00000372997 1919 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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FOXC1Q12948 ZNF540-202ENST00000343599 3073 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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FOXC1Q12948 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
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FOXC1Q12948 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
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FOXC1Q12948 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 MS4A3-203ENST00000395032 867 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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FOXC1Q12948 RAD21-201ENST00000297338 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 CDH26-202ENST00000348616 3182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 ALDH6A1-202ENST00000553458 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 MAP4-209ENST00000434267 2772 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 ABLIM1-205ENST00000369266 2230 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 C2orf42-201ENST00000264434 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
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