Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 ZSWIM7-209ENST00000486655 726 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC022306.1-201ENST00000560489 1562 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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