Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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