Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms