Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP20Q9Y2K6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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