Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms