Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms