Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms