Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN88

GABRQ, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRQQ9UN88 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms