Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms