Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRQQ9UMZ3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms