Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms