Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms