Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms