Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms