Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNL1Q9UK58 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms