Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN11AQ9UI33 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms