Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms