Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP25Q9UHP3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms