Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms