Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms