Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRP2BPQ9P2M1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRP2BPQ9P2M1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRP2BPQ9P2M1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP2BPQ9P2M1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms