Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
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