Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC40.22■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC40.22■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC40.2■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC40.2■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms