Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMG20BQ9P0W2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms