Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA3Q9NZ52 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms