Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms