Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALKBH4Q9NXW9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms