Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms