Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms