Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATG3Q9NT62 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG3Q9NT62 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms