Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms