Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS45Q9NRW7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms