Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUOX1Q9NRD9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms