Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms