Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IL1RAPQ9NPH3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms