Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms