Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRABDQ9H4I3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms