Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms