Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms