Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP1Q9C000 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms