Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms